Αποφοίτησε την Ιατρική Σχολή του Πανεπιστημίου Κρήτης. 

Απέκτησε Μεταπτυχιακό Δίπλωμα Ειδίκευσης στην “Έρευνα στη Γυναικεία Αναπαραγωγή” από την Ιατρική Σχολή του Εθνικού και Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών με βαθμό Άριστα.

Ανακηρύχθηκε Διδάκτορας της Ιατρικής Σχολής του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων με θέμα της διδακτορικής διατριβής  “Υποθαλαμική αμηνόρροια”.

Ο Γιάννης Κουτουλάκης είναι χειρουργός γυναικολόγος – μαιευτήρας. 

Ολοκλήρωσε την ειδίκευση του στη Μαιευτική – Γυναικολογία στο Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο Ιωαννίνων. Κατά τη διάρκεια της εκπαίδευσης του έδωσε ειδικό ενδιαφέρον στην Γυναικολογική Ενδοκρινολογία και στην Υποβοηθούμενη Αναπραγωγή.

Ακολούθησε μετεκπαίδευση στη Γυναικολογική Ογκολογία στο University College London Hospital και έπειτα μετεκπαιδεύτηκε στην Υστεροσκοπική και Λαπαροσκοπική Χειρουργική στο Royal Free London Hospital.

Περάτωσε την μετεκπαίδευση του στην κολποσκόπηση και στη διερεύνηση και θεραπεία της παθολογίας του τραχήλου της μήτρας στο Royal Free London Hospital και είναι μέλος του ” The British Society for Colposcopy and Cervical Pathology”.

Υπήρξε Ακαδημαϊκός Υπότροφος και Επιστημονικός Συνεργάτης της Α’ Μαιευτικής & Γυναικολογικής κλινικής του Πανεπιστημίου Αθηνών στη Μονάδα Ιατρικώς Υποβοηθούμενης Αναπαραγωγής.

Εργάστηκε ως γυναικολόγος στην μονάδα ιατρικώς υποβοηθούμενης αναπαραγωγής IVF SERUM από τον Σεπτέμβριο του 2016 ως Μαϊο του 2017.

Εργάστηκε ως επιστημονικός υπεύθυνος στην μονάδα ιατρικώς υποβοηθούμενης αναπαραγωγής IVF SERUM από το 2017 ως τον Μαϊο του 2024.

Σήμερα διατηρεί ιατρείο στο Κολωνάκι και στον Άγιο Νικόλαο Κρήτης από το 2015 όπου εκτός των άλλων  πραγματοποιεί μια σειρά επεμβάσεων στο ιατρείο χωρίς αναισθησία όπως υστεροσκόπηση ιατρείου , λήψη βιοψιών και loop ectomy. 

Είναι υπεύθυνος γυναικολόγος στο SILLIPSIS IVF από τον Μαΐο του 2024. 

Είναι συνεργάτης όλων των μεγάλων Γυναικολογικών και Μαιευτικών κλινικών της Αθήνας.